Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP160Q12769 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NUP160Q12769 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms