Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RELAQ04206 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RELAQ04206 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RELAQ04206 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RELAQ04206 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RELAQ04206 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RELAQ04206 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RELAQ04206 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RELAQ04206 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RELAQ04206 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RELAQ04206 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RELAQ04206 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RELAQ04206 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RELAQ04206 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RELAQ04206 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RELAQ04206 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RELAQ04206 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RELAQ04206 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RELAQ04206 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RELAQ04206 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RELAQ04206 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RELAQ04206 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RELAQ04206 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RELAQ04206 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RELAQ04206 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms