Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
BEX3Q00994 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BEX3Q00994 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms