Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
RPS29P62273 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
RPS29P62273 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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