Protein–RNA interactions for Protein: P60411

KRTAP10-9, Keratin-associated protein 10-9, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-9P60411 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP10-9P60411 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms