Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RHBDL3P58872 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL3P58872 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms