Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRG3P56975 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRG3P56975 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRG3P56975 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRG3P56975 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRG3P56975 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NRG3P56975 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NRG3P56975 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms