Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH15P55291 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDH15P55291 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDH15P55291 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms