Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CASP6P55212 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CASP6P55212 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP6P55212 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP6P55212 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP6P55212 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP6P55212 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP6P55212 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP6P55212 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP6P55212 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CASP6P55212 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CASP6P55212 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP6P55212 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP6P55212 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP6P55212 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP6P55212 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP6P55212 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP6P55212 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP6P55212 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP6P55212 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CASP6P55212 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms