Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP12AP54707 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms