Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GBX2P52951 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GBX2P52951 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GBX2P52951 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms