Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
SMARCA2P51531 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SMARCA2P51531 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms