Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PTDSS1P48651 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms