Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NEDD4P46934 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD4P46934 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms