Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GATA4P43694 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GATA4P43694 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GATA4P43694 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms