Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV4P43268 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETV4P43268 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETV4P43268 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETV4P43268 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETV4P43268 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ETV4P43268 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV4P43268 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV4P43268 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV4P43268 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV4P43268 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV4P43268 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV4P43268 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV4P43268 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV4P43268 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV4P43268 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV4P43268 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV4P43268 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ETV4P43268 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms