Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PIK3CBP42338 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms