Protein–RNA interactions for Protein: P35218

CA5A, Carbonic anhydrase 5A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA5AP35218 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CA5AP35218 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CA5AP35218 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CA5AP35218 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CA5AP35218 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CA5AP35218 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CA5AP35218 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CA5AP35218 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CA5AP35218 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CA5AP35218 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CA5AP35218 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CA5AP35218 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CA5AP35218 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CA5AP35218 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CA5AP35218 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms