Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DSG3P32926 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DSG3P32926 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DSG3P32926 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 LINC01370-202ENST00000445606 731 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DSG3P32926 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms