Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BRS3P32247 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
BRS3P32247 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
BRS3P32247 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms