Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CD38P28907 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CD38P28907 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CD38P28907 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CD38P28907 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD38P28907 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD38P28907 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD38P28907 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD38P28907 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD38P28907 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CD38P28907 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD38P28907 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD38P28907 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CD38P28907 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms