Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HLA-DMAP28067 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HLA-DMAP28067 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms