Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PSMB9P28065 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSMB9P28065 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms