Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GABRR1P24046 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms