Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRKACBP22694 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms