Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERBB3P21860 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERBB3P21860 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms