Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EFNA1P20827 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms