Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP4AP20648 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP4AP20648 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms