Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATF3P18847 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATF3P18847 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATF3P18847 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATF3P18847 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATF3P18847 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATF3P18847 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ATF3P18847 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATF3P18847 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATF3P18847 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF3P18847 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF3P18847 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF3P18847 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF3P18847 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF3P18847 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF3P18847 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF3P18847 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF3P18847 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF3P18847 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF3P18847 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF3P18847 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF3P18847 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF3P18847 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATF3P18847 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATF3P18847 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms