Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CREB1P16220 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CREB1P16220 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CREB1P16220 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CREB1P16220 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CREB1P16220 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms