Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LAMC1P11047 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LAMC1P11047 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms