Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GLI4P10075 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GLI4P10075 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GLI4P10075 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GLI4P10075 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GLI4P10075 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GLI4P10075 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GLI4P10075 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GLI4P10075 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GLI4P10075 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GLI4P10075 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GLI4P10075 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GLI4P10075 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GLI4P10075 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GLI4P10075 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI4P10075 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms