Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACAA1P09110 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms