Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MSMBP08118 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MSMBP08118 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MSMBP08118 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSMBP08118 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSMBP08118 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSMBP08118 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSMBP08118 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSMBP08118 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSMBP08118 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSMBP08118 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSMBP08118 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSMBP08118 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
MSMBP08118 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSMBP08118 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSMBP08118 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSMBP08118 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MSMBP08118 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MSMBP08118 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSMBP08118 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSMBP08118 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSMBP08118 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSMBP08118 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSMBP08118 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSMBP08118 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSMBP08118 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSMBP08118 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSMBP08118 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSMBP08118 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MSMBP08118 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSMBP08118 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
MSMBP08118 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MSMBP08118 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms