Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SERPIND1P05546 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms