Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C9P02748 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C9P02748 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9P02748 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9P02748 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms