Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
F9P00740 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
F9P00740 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
F9P00740 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
F9P00740 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
F9P00740 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
F9P00740 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F9P00740 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F9P00740 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F9P00740 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F9P00740 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F9P00740 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F9P00740 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
F9P00740 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F9P00740 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F9P00740 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F9P00740 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
F9P00740 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F9P00740 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F9P00740 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
F9P00740 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
F9P00740 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
F9P00740 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms