Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CBX7O95931 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CBX7O95931 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms