Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLR1AO95602 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLR1AO95602 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms