Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAPGEF3O95398 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAPGEF3O95398 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RAPGEF3O95398 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
RAPGEF3O95398 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RAPGEF3O95398 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RAPGEF3O95398 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RAPGEF3O95398 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms