Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KA4O75676 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KA4O75676 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms