Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRMUO75648 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRMUO75648 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRMUO75648 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRMUO75648 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms