Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VAMP4O75379 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms