Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PPFIA3O75145 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms