Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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HOXA3O43365 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
HOXA3O43365 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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