Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PHF1O43189 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PHF1O43189 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PHF1O43189 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms