Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KDM6AO15550 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms