Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYNMO15061 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNMO15061 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNMO15061 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNMO15061 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNMO15061 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNMO15061 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNMO15061 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNMO15061 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNMO15061 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SYNMO15061 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNMO15061 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNMO15061 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNMO15061 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNMO15061 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNMO15061 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNMO15061 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNMO15061 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNMO15061 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNMO15061 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNMO15061 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SYNMO15061 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SYNMO15061 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYNMO15061 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYNMO15061 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYNMO15061 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYNMO15061 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYNMO15061 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYNMO15061 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SYNMO15061 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNMO15061 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNMO15061 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNMO15061 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNMO15061 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNMO15061 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNMO15061 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNMO15061 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNMO15061 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNMO15061 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNMO15061 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNMO15061 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNMO15061 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYNMO15061 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNMO15061 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNMO15061 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNMO15061 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNMO15061 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNMO15061 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNMO15061 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNMO15061 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNMO15061 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNMO15061 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNMO15061 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNMO15061 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNMO15061 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYNMO15061 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNMO15061 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNMO15061 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNMO15061 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNMO15061 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNMO15061 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNMO15061 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNMO15061 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNMO15061 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNMO15061 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYNMO15061 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms