Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLGNO14967 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLGNO14967 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLGNO14967 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLGNO14967 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLGNO14967 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLGNO14967 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLGNO14967 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLGNO14967 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLGNO14967 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLGNO14967 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLGNO14967 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLGNO14967 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLGNO14967 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLGNO14967 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLGNO14967 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLGNO14967 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLGNO14967 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLGNO14967 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLGNO14967 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLGNO14967 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLGNO14967 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms