Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLRMTO00411 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POLRMTO00411 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms